NBS1 基因对胃癌基因表达的影响

祥鑫 孟(德州市第三人民医院，中国)

摘要

通过降低NBS1在HGC-27细胞株中的表达，研究胃癌（Gastric cancer，GC）早期应答基因的动态变化。分别提取HGC-27细胞株抑制前、抑制24小时后和48小时后细胞株样本的总mRNA。利用Fluidigm Biomark平台对48种胃癌相关基因表达进行监测，并进行功能通路进行分析。与抑制前相比，24h后细胞株中12个基因表达量上调，6个基因表达下调；48h后，16个基因表达上调，8个基因表达下调；两个时间点同时差异表达的基因有10个。这些基因主要调控细胞迁移及血管生成等功能，主要参与调控的功能通路包括癌症通路、胃癌和MAPK信号通路等。抑制NBS1的表达可能会导致细胞增殖速率降低最终导致细胞凋亡，NBS1的过表达可能会促进癌细胞增殖。

关键词

胃癌；NBS1；HGC-27细胞株；功能通路；细胞周期

参考

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表 2 差异基因 KEGG 功能富集结果PathwayTermP.valueGeneshsa05225肝细胞癌1.47E-08TGFB1, PTEN, IGF2, E2F1, MET, TGFBR2hsa05225癌症途径4.68E-08NTRK1, TGFB1, PTEN, IGF2, E2F1, MET, TGFBR2hsa04010MAPK信号通路1.85E-05NTRK1, TGFB1, IGF2, MET, TGFBR2hsa05226胃癌9.23E-05TGFB1, E2F1, MET, TGFBR2hsa04218细胞衰老1.06E-04TGFB1, PTEN, E2F1, TGFBR2hsa05230癌症中的中心碳代谢9.34E-04NTRK1, PTEN, METhsa05218黑色素瘤9.88E-04PTEN, E2F1, METhsa05220慢性髓性白血病1.10E-03TGFB1, E2F1, TGFBR2hsa04151PI3K-Akt信号通路1.24E-03NTRK1, PTEN, IGF2, MET

DOI: http://dx.doi.org/10.12345/yzlcyxzz.v8i3.24720